Zenodo
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Zenodo
- Updated on 13 Sep 2024
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Zenodo es un repositorio de acceso abierto que nos permite depositar conjuntos de datos, software de investigación, informes, artículos de investigación sin tener que esperar a que sean publicados y cualquier otro producto relacionado con la investigación.
En definitiva, permite compartir nuestros resultados de investigación con el mundo de forma rápida y sencilla. También ayuda a garantizar que los resultados de la investigación sean accesibles y reutilizables por otros investigadores.
Entre las principales características de Zenodo destacaríamos las siguientes:
Acceso abierto: Todos los contenidos de Zenodo están disponibles de forma gratuita y sin restricciones.
Multidisciplinar: Zenodo acepta contenidos de cualquier disciplina científica.
Fácil de usar: Zenodo tiene una interfaz de usuario intuitiva que facilita el depósito de contenidos.
Interoperable: Zenodo está interconectado con otros repositorios de acceso abierto, lo que facilita la búsqueda y el descubrimiento de contenidos.
Son varias las ventajas de utilizar Zenodo para compartir los resultados de la investigación:
Mayor visibilidad: Los contenidos depositados en Zenodo son visibles para una amplia audiencia.
Mejor replicabilidad: Los conjuntos de datos depositados en Zenodo pueden ser utilizados por otros investigadores para reproducir los resultados publicados.
Mayor impacto: Los contenidos depositados en Zenodo pueden aumentar el impacto de la investigación.
Zenodo puede ayudar a nuestra organización a aumentar la visibilidad y el impacto de nuestro trabajo.
Fundanet interconectado con Zenodo
Fundanet incorpora un nuevo servicio que le permitirá depositar su producción científica en el repositorio Zenodo. Comunicación que se lleva a cabo a través de la API REST de Zenodo.
Este servicio es un Ad-on del módulo de producción científica y para su puesta en marcha debe ponerse en contacto con nuestro departamento de Desarrollo de Negocio.
Si su módulo de producción científica incluye este Ad-on, una vez le facilite a su Consultor de referencia el Token, éste configurará el sistema para que Fundanet pueda comunicarse con la API REST de Zenodo de manera segura y autorizada.
El Token es una forma de autenticación y seguridad para garantizar que sólo los sistemas autorizados pueden interactuar con la API de Zenodo. Funciona como una llave digital que otorga acceso y asegura que las acciones realizadas a través de la API sean realizadas por Fundanet y no por otros sistemas.
Para obtener el Token acceda a Zenodo, inicie sesión y diríjase a la opción Applications. Desde esta opción acceda a la sección Personal Access Tokens y genere un Nuevo Token (+ New Token).
Configurado Fundanet para el acceso a la API de Zenodo debe utilizar la opción “Depósito” para enviar su producción científica a Zenodo. Opción que encontrará en el menú “Repositorio” del módulo de producción científica.
La comunicación entre Fundanet y Zenodo se establecerá en base a una serie de requisitos que deben cumplir los ítems a depositar y a una serie de metadatos requeridos por Zenodo para cada ítem.
Directrices de extracción básicas
Inicialmente definiremos las condiciones que deben cumplir los ítems que gestiona con Fundanet para que sean susceptibles de ser depositados en Zenodo. Estas condiciones básicas serían las siguientes:
- El ítem debe estar marcado para que sea visible en la web
- debe tener fecha de publicación
- al menos uno de sus autores es de nuestra organización
- debe tener información digital cuyo período de publicación en la web esté activo o alguna de las versiones del artículo.
Si necesitamos añadir alguna condición adicional su Consultor de referencia podrá llevar a cabo los ajustes necesarios.
Metadatos y su Equivalencia en Fundanet
Zenodo establece un conjunto de metadatos para los ítems que depositemos en su repositorio. Cada uno de los metadatos del ítem contendrá información específica y deberemos cumplir las especificaciones que Zenodo establece para cada uno de ellos. Especificaciones que principalmente se refieren a la obligatoriedad o no del metadato, al formato de la información que contiene o al contenido específico que debemos comunicar si este se refiere a un vocabulario controlado.
A continuación vamos a identificar a cada uno de los metadatos que nos solicita Zenodo y su equivalencia en Fundanet para el depósito de publicaciones. De esta forma sabremos qué información enviamos de cada publicación.
Metadato | Requerido | Descripción y equivalencia en Fundanet |
|---|---|---|
upload_type | Sí | Recibe su valor de un vocabulario controlado definido por Zenodo. El propósito es que informemos a través de este metadato del tipo de recurso que vamos a depositar. Fundanet podrá indicar en este campo cualquier valor que se corresponda con cualquier recurso gestionado en el módulo de producción científica. Para el caso que nos incumbe enviaremos en este metadato el valor publication. Vocabulario controlado de Zenodo: * publication: Publication * poster: Poster * presentation: Presentation * dataset: Dataset * image: Image * video: Video/Audio * software: Software * lesson: Lesson * physicalobject: Physical object * other: Other |
publication_type | Sí, si upload_type es “publication” | Cuando el valor indicado en el metadato upload_type sea publication el valor de este metadato solo podrá ser uno de los valores del vocabulario controlado definido por Zenodo para este metadato.
Fundanet establecerá la equivalencia entre su vocabulario controlado asociado a la propiedad Alcance de la publicación y este vocabulario controlado de Zenodo. Vocabulario Controlado de Zenodo: * annotationcollection: Annotation collection * book: Book * section: Book section * conferencepaper: Conference paper * datamanagementplan: Data management plan * article: Journal article * patent: Patent * preprint: Preprint * deliverable: Project deliverable * milestone: Project deliverable * proposal: Proposal * report: Report * softwaredocumentation: Software documentation * taxonomictreatment: Taxonomic treatment * technicalnote: Technical note * thesis: Thesis * workingpaper: Working paper * other: Other Equivalencia con el Vocabulario controlado de Fundanet (Alcance de la publicación):
* book: Book (COM: Libro Completo | BRV: Book Review) * section: Book section (CAP: Book Chapter) * conferencepaper: Conference paper (CFP: Conference Paper) * article: Journal article (ART: Article) * workingpaper: Working paper (Cualquier Documento Técnico) * other: Other (El resto de alcances) |
image_type | Sí, si upload_type es “image” | Siempre vacío |
publication_date | Sí | Fecha de publicación en formato ISO8601 (YYYY-MM-DD) |
title | Sí | Titulo de la publicación |
creators | Sí | Autores de la publicación. Cada elemento de la colección tendrá tres propiedades. |
name | Sí | Nombre del autor |
orcid | Opcional | ORCID ID del autor |
affiliation | Opcional | Filiación del autor. Si el autor estuviera asociada a dos o más filiaciones de la publicación se incluirán en este metadato todas ellas separadas por punto y coma. |
description | Sí | Abstract de la publicación. Como es obligatorio, cuando la publicación no tiene abstract enviamos el siguiente texto: Abstract not available |
access_right | Sí | Recibe su valor de un vocabulario controlado definido por Zenodo.
El valor que le asigna Zenodo por defecto si se deja vacío es “open”.
Vocabulario controlado de Zenodo: * open: Open Access * embargoed: Embargoed Access * restricted: Restricted Access * closed: Closed Access
Lógica para el rellenado de este metadato:
|
license | Sí, si access_right es “open” o “embargoed” | Es obligatorio si el metadato access_right es "open" or "embargoed"
La licencia seleccionada aplica a todos los archivos que van adjuntos en el depósito, pero no a los metadatos, los cuales quedan licenciados bajo la licencia CC0 waiver. El valor por defecto si estamos enviando un dataset se establece a cc-zero si no se informa del metadato o a cc-by para cualquier otro tipo de recurso.
Actualmente Fundanet no cuenta con la posibilidad de indicar con qué licencia se distribuyen los archivos del recurso depositado, por lo tanto se deja el campo vacío para que Zenodo les asigne por defecto el valor cc-by. |
embargo_date | Sí, si access_right is “embargoed” | Fecha en la que el sistema pondrá automáticamente a disposición del público los ficheros depositados. Por defecto es la fecha actual. Es obligatorio y se notifica si el metadato access_right es "embargoed". En este metadato, Fundanet indica la fecha resultante de sumar a la fecha de publicación el número de meses de embargo establecidos en la sección de copyright de la revista, más 1. Esto ocurre siempre que la información del copyright de la revista esté confirmada y los meses de embargo de la versión publicada sean mayores que cero. |
access_conditions | Sí, si access_right es “restricted” | Nos permite especificar las condiciones bajo las cuales concedemos acceso a los archivos depositados, cuando el metadato access_right es "restricted".
Como en ninguno de los casos enviamos el valor "restricted" en el metadato access_righ, siempre dejamos este campo vacío |
doi | No | DOI de la publicación si lo tiene |
preserve_doi | No | Cuando la publicación no tiene DOI lo enviamos a TRUE para que ZENODO se lo asigne automáticamente. |
keywords | No | Palabras clave de la publicación |
notes | No | Agradecimientos de la publicación |
related_identifiers | No | Se informa del DOI de aquellos ítems que primeramente no lo tenían, y se le indicó a Zenodo que les asignara uno automáticamente. |
contributors | No | Se informa en este metadato de aquellos participantes de la publicación en calidad distinta de autor (AU). |
name | Sí | Nombre del participante |
type | Sí | Tipo de participación. El valor de este metadato solo podrá ser uno de los valores del vocabulario controlado definido por Zenodo. Vocabulario controlado: ContactPerson, DataCollector, DataCurator, DataManager,Distributor, Editor, HostingInstitution, Producer, ProjectLeader, ProjectManager, ProjectMember, RegistrationAgency, RegistrationAuthority, RelatedPerson, Researcher, ResearchGroup, RightsHolder,Supervisor, Sponsor, WorkPackageLeader, Other
Equivalencia con el Vocabulario controlado de Fundanet para la propiedad “En Calidad de” de los participantes en la publicación:
Editor: Editor; Researcher: Colaborador; ResearchGroup:Autoría Conjunta; El resto de valores Other: El resto de tipos de participación |
affiliation | Opcional | Filiación o Filiaciones de la publicación con las que está asociado. |
orcid | Opcional | Orcid del participante |
gnd | Opcional | Identificador GND |
references | No | No hay correspondencia con Fundanet y se envía siempre vacío. |
Comunities | No | Lista de comunidades en las que se desea que aparezcan las publicaciones depositados. El propietario de la comunidad recibirá una notificación y podrá aceptar o rechazar la solicitud.
Por defecto, se configuran las siguientes comunidades: Zenodo: (https://zenodo.org/communities/zenodo) European Commission Funded Research (OpenAIRE) (https://zenodo.org/communities/ecfunded)
Las comunidades se configuran a nivel de instalación antes de llevar a cabo el primer depósito. Por lo tanto, todos los ítems depositados se incluirán en la comunidad o comunidades configuradas.
Si puntualmente se necesita que alguna publicación se asocie con una comunidad diferente de las configuradas en la instalación, se deberá acceder a Zenodo para realizar la modificación necesaria en la publicación. |
grants | No | Proyecto o Proyectos que han financiado la publicación que se va a depositar. |
id | Sí | Se informa del proyecto y del financiador de cada proyecto asociado con la publicación. El dato que se envía para ambos es su identificador en los vocabularios controlados de Zenodo.
Zenodo admite como identificador del financiador el identificador ROR. Identificador que puede localizarse en la siguiente página: https://ror.org
Si el stakeholder del proyecto en calidad de financiador o promotor tiene asignado este identificador, en su ficha de tercero, y el proyecto tiene el identificador en la propiedad “Referencia Cliente / Promotor”, se rellenará este metadato y se enviará la información junto con el depósito de la publicación.
Si por un casual alguno de los dos identificadores que facilitamos no es reconocido por Zenodo, éste nos informará con una incidencia en el momento de efectuar el depósito. |
journal_title | No | Título de la revista si el medio asociado a la publicación es una revista. En caso contrario se envía vacío. |
journal_volume | No | Volumen de la revista si el medio asociado a la publicación es una revista |
journal_issue | No | Ejemplar de la revista si el medio asociado a la publicación es una revista |
journal_pages | No | Páginas en las que se encuentra la publicación si el medio asociado a la publicación es una revista.
Cuando el artículo aún no se ha publicado, y por lo tanto no tiene fecha de publicación ni asignadas las páginas en las que figurará en la revista, se facilita el número electrónico del artículo si estuviera registrado en Fundanet.
Cuando tiene fecha de publicación ya se conocen las páginas y utilizaremos los campos correspondientes formateados "Pag.Inicial - Pag.Final". Si faltara alguna de ambas páginas utilizaremos el mismo formato utilizando sólo la página que exista:
|
conference_title | No | Título del evento cuando la publicación esté vinculada con un evento |
conference_acronym | No | Acrónimo del evento. Vacío si el metadato conference_title está vacío |
conference_dates | No | Fechas del evento. Vacío si el metadato conference_title está vacío. |
conference_place | No | "Ciudad, País". Lugar donde se desarrolla el evento. Vacío si el metadato conference_title está vacío. |
conference_url | No | Url del evento. Vacío si el metadato conference_title está vacío. |
conference_session | No | Siempre vacío, no hay correspondencia en Fundanet |
conference_session_part | No | Siempre vacío, no hay correspondencia en Fundanet |
imprint_publisher | No | Editorial del libro. Si se trata de una publicación en revista, este metadato informa de la editorial del libro que estuviera asociado con el evento asociado a la publicación. |
imprint_isbn | No | ISBN del libro o informe. Si se trata de una publicación en revista, este metadato informa del ISBN del libro que estuviera asociado con el evento. |
imprint_place | No | Lugar de publicación del libro (País) |
partof_title | No | Título del libro para los capítulos |
partof_pages | No | Número de páginas de la publicación en el libro.
Utilizaremos los campos correspondientes formateados "Pag.Inicial - Pag.Final". Si faltara alguna de ambas páginas utilizaremos el mismo formato utilizando sólo la página que exista: "Pag.Inicial - Pag.Inicial si sólo contamos con la inicial o "Pag.Final - Pag.Final" si sólo contamos con la final. |
subjects | No | Siempre vacío, no hay correspondencia en Fundanet |
version | No | Siempre vacío, no hay correspondencia en Fundanet |
languaje | No | Idioma de la publicación. En el caso de publicaciones en libros o revistas el idioma se toma del medio. Para documentos técnicos el dato se coge de la propiedad “idioma” del propio documento técnico.
Debe informarse en formato ISO 639-2 o 639-3 (https://www.loc.gov/standards/iso639-2/php/code_list.php) |
locations | No | Siempre vacío, no hay correspondencia en Fundanet |
Dates | No | Siempre vacío, no hay correspondencia en Fundanet |
method | No | Siempre vacío, no hay correspondencia en Fundanet |
Incidencias durante el depósito
Durante el proceso de depósito, Zenodo nos informará sobre posibles incidencias que puedan surgir. Estas incidencias pueden abarcar desde problemas relacionados con la comunicación hasta incoherencia en los datos que estamos enviando.
Estos son algunos ejemplos de mensajes. Los mensajes tienen dos partes. La primera parte se corresponde con el mensaje original de Zenodo, mientras que la segunda, resaltada en negrita, ha sido añadida por Fundanet para proporcionar información adicional sobre el problema y, si es necesario, sugerir formas de resolverlo.
400 (BAD REQUEST): {"status": 400, "message": "Invalid value 01CWQZE88."} Financiador no incluido en los catálogos de Zenodo. Revise los datos de financiación de esta publicación
400 (BAD REQUEST): {"status": 400, "message": "Invalid value 021nxhr62::FIS:EC040209."} Proyecto no incluido en los catálogos de Zenodo. Revise los datos de financiación de esta publicación
400 (BAD REQUEST): {"status": 400, "message": "A validation error occurred.", "errors": [{"field": "pids.doi", "messages": ["doi:10.1016/j.ijbiomac.2017.01.140 already exists."]}]} Esta publicación se subió a Zenodo con otra utilidad y no es posible su actualización. Sin embargo, Zenodo ha permitido el depósito de esta nueva versión de la publicación en estado Draft. Por lo tanto, debe acceder a Zenodo para resolver el conflicto.
400 (BAD REQUEST): {"status": 400, "message": "The persistent identifier is already registered."}
500 (INTERNAL SERVER ERROR)
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